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如何正確獲取離體根系圖像

2022-06-23 14:48:04 點(diǎn)將科技 462

分析原理

       通過(guò)掃描儀將離體洗好的根系掃描獲取圖像,使用專業(yè)根系分析軟件對(duì)根系圖像分析,得到根系長(zhǎng)度、平均直徑、表面積、體積、根尖數(shù)等根系表型數(shù)據(jù)。分析的直接對(duì)象是圖片,所以獲取高質(zhì)量的根系圖片獲得準(zhǔn)確數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)。

         適用于DJ-GX02根系分析儀。

適用對(duì)象:

離體洗根后的植物根系

圖像獲取設(shè)備:

        儀器標(biāo)配含有經(jīng)過(guò)嚴(yán)格校準(zhǔn)的掃描儀以保證圖像的質(zhì)量。每臺(tái)掃描儀配有專用控制軟件,用于參數(shù)設(shè)置和圖像獲取、保存。

       如果使用普通掃描儀,只有掃描頭部位的光源,也就是下方照光,因?yàn)楦档牧Ⅲw結(jié)構(gòu),根系在背景板上會(huì)留下陰影,掃描出來(lái)的圖像上,根系附近就有陰影,圖像不夠清晰,影響分析。


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       雙光源投射掃描,上方照光,下方掃描成像,得到根系的投影。由于光源來(lái)自于上方,沒(méi)有根系的地方將是白色的背景,有根系的地方光受根系遮擋,根系呈現(xiàn)黑色,四周邊界清晰,根與背景區(qū)分非常明顯,對(duì)分析非常有利。

圖片關(guān)鍵詞圖片關(guān)鍵詞

掃根成像:

      使用投射掃描時(shí),需要將上光源的背景板取下,否則背景板將上光源遮擋,掃描的圖像將一團(tuán)黑。

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        放置定位框,按照如圖所示的方向,注意定位框凹陷一端(箭頭所指)的位置。為了放置根盤直接壓在上光源玻璃板上,隨貨配有增高墊,如左下圖所示,放置在面板上。

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洗好的根系放置在根盤內(nèi),隨貨配有3種不同尺寸的根盤,選擇適合根系大小的,放入根系和清水,細(xì)小的根系在水中會(huì)分散開(kāi),便于成像。

 對(duì)于根系基部比較大的根系,比如樹(shù)苗、玉米的根,可將根系分別剪下來(lái),平鋪到根盤中;

 如果一個(gè)根系上根的數(shù)量很大,可以分多次掃描,分析時(shí)將根盤的數(shù)據(jù)累加;

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     掃描根系可以提前預(yù)覽,保存只有根系的圖像,拋棄根盤的區(qū)域,便于后面軟件直接自動(dòng)分析。

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掃描參數(shù)的設(shè)置:

        掃描參數(shù)決定了掃描圖像的質(zhì)量,參數(shù)中最為關(guān)鍵的是分辨率,一般設(shè)置300ppi即可,滿足絕大多數(shù)樣品的成像需求;如果樣品非常細(xì)小,可以選擇更高的分辨率值,比如600ppi;設(shè)置是在成像控制軟件界面。更高的分辨率意味著圖像占的內(nèi)存更大。

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    圖像掃描完成后,要保存到計(jì)算機(jī)硬盤中,選擇jpg、tiff均可。建議先將所有根系的圖像全部掃描完成后再進(jìn)行圖像分析,軟件有批處理分析功能。

3副根系掃描圖

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